En Takashi Natsume s’ha acostumat a les seves trobades amb els youkai a través del Llibre d’Amics, que conté els noms dels youkai que la seva àvia, la Reiko Natsume, va segellar en contractes. Aquestes trobades permeten a en Natsume entendre millor els youkais, en Reiko i a ell mateix. El Llibre d’Amics és una potent eina que es pot utilitzar per a controlar els youkais; és cercat tant per youkais com per exorcistes. En Natsume només vol viure la seva vida quotidiana en pau, però es veu constantment pertorbat per aquestes experiències. Si vol posar fi a aquest turment, en Natsume haurà d’explorar més coses sobre el llibre i el món de l’exorcisme, així com començar a obrir el cor a aquells que el puguin ajudar.

Intel·ligent, refinada i sorprenentment bella, la mitat russa i mitat japonesa Alisa Mikhailovna Kujou és considerada l'ídol de la seua escola. Amb el seu llarg cabell platejat, els seus fascinants ulls blaus i la seua pell excepcionalment clara, ha capturat els cors d'innombrables estudiants homes i al mateix temps és molt admirada per tots els altres. Així i tot, a causa de la seua personalitat aparentment inaccessible, tots continuen sent cautelosos amb la xica quasi perfecta.

Una de les poques excepcions és el company de banc de Alisa, Masachika Kuze, un xic relativament mitjà que passa els seus dies veient anime i jugant jocs de cota. Malgrat el seu comportament indiferent, Masachika és l'únic estudiant que rep l'atenció de Alisa. Incapaç de ser completament honesta, Alisa sovint és dura amb Masachika i només expressa el seu afecte en rus. No obstant això, sense que ella ho sàpia, Masachika realment entén l'idioma però simplement fingix el contrari per a la seua pròpia diversió.

A mesura que l'estranya parella continua intercanviant comentaris enginyosos i divertits, la seua relació es torna gradualment més romàntica i encantadora, i Alisa podria finalment aprendre a transmetre lliurement els seus verdaders sentiments.